点击右上角微信好友

朋友圈

请使用浏览器分享功能进行分享

正在阅读:花鼠染色体水平基因组首次破译成功
首页> 教育频道> 光明教育 > 正文

花鼠染色体水平基因组首次破译成功

来源:光明网-《光明日报》2023-01-06 03:41

  【科技前沿】

  光明日报呼和浩特1月5日电 记者高平、王潇从内蒙古自治区科技厅获悉,近日,赤峰学院农学院相吉山研究员科研团队联合曲阜师范大学生命科学学院易现峰教授团队首次破译了花鼠的染色体水平基因组,成功组装了全球第一个花鼠属物种的染色体水平基因组。该研究得到了国家自然科学基金的支持,研究成果在国际期刊《科学数据》(Scientific Data)在线发表。

  花鼠别名金花鼠、五道眉、花栗鼠,是一种松鼠科鼠类,为小型半树栖半地栖动物,主要栖息于山区与平原的针叶林、针阔混交林以及阔叶林和多灌丛地区。花鼠是唯一在古北界分布的花鼠属物种,国外主要分布于俄罗斯西伯利亚、蒙古、朝鲜和日本,国内则主要分布于长江以北的广大地区。花鼠作为重要的分散贮藏鼠类,在植物种子扩散、幼苗建成、种群扩张以及森林更新中具有举足轻重的作用。截至目前,针对花鼠的研究主要围绕生物学特性、行为、生态和系统地理学等;而该物种的基因组测序仍有很大的空白,制约了花鼠遗传和进化机制的研究。

  据介绍,科研团队综合利用因美纳公司测序、第三代单分子实时测序和染色体交互捕获等多种技术,首次组装了一只捕自内蒙古赤峰市旺业甸林场的雌性花鼠的染色体水平基因组。基于转录组证据、同源搜索等对基因组进行了分析,预测得到25311个蛋白编码基因,其中94.73%的基因得到功能注释。这些结果表明花鼠基因组具有较高的完整性和准确性,综合组装质量达到高水平。

  科研团队通过基因组结构注释分析判定重复序列共1.03Gb,占花鼠全基因组的38.87%。染色体共线性分析发现,花鼠与其他两个具有染色体水平基因组的物种北松鼠和北美灰松鼠具有很强的同源性,同时,也发现了松鼠基因组进化过程中具有染色体重排的现象。除此之外,研究组选择花鼠在内的20个代表性物种进行同源基因家族鉴定,共鉴定出20个物种共有基因家族20952个以及花鼠特有的基因家族148个,这为确定花鼠的系统发育地位和进化历史提供了有效的分子数据。

  《光明日报》( 2023年01月06日 08版)

[ 责编:王蕾 ]
阅读剩余全文(

相关阅读

您此时的心情

光明云投
新闻表情排行 /
  • 开心
     
    0
  • 难过
     
    0
  • 点赞
     
    0
  • 飘过
     
    0

视觉焦点

  • 贵州开行节后首趟高铁务工返岗专列

  • 济南游览趵突泉花灯会人数超35万

独家策划

推荐阅读
2023年1月26日,福建省福州市非遗展示馆,畲族演员现场舞蹈展演。该展示馆推出了畲族非遗、传统纺织技艺、现场舞蹈展演等迎新春活动,邀市民、游客共庆新春佳节。
2023-01-27 07:52
2023年1月24日,浙江省台州市临海市紫阳古街热闹非凡,吸引了广大市民和游客前来观光游览,乐享春节假期
2023-01-27 07:47
内蒙古乌兰察布:雪后火山别样美
2023-01-25 16:37
兔年的中国“味道”
2023-01-24 17:12
欢乐的节日
2023-01-23 17:40
2023年1月21日,祁连山国家公园甘肃省张掖段肃南片区雪后美景。一场降雪过后,祁连山国家公园甘肃省张掖段肃南片区,远处的巍峨祁连山脉被皑皑白雪层层包裹,苍松翠柏,矗立其间,雪后草原,分外妖娆。
2023-01-23 11:22
2023年1月19日,雪霁初晴的甘肃省张掖七彩丹霞景区,在晨光照耀下,丹山沟壑明暗鲜明、韵律奇妙、唯美如画。
2023-01-20 09:31
2023年1月18日,郑州北车辆段熔接工正在对货车车辆配件进行切割作业。
2023-01-19 10:03
2023年1月17日晚,山西省运城市“关公故里中国年”盐湖七彩灯会在河东池盐文化博览园中禁门广场举行
2023-01-18 09:54
 2023年1月15日,全球首架C919国产大飞机抵达青岛胶东国际机场进行验证飞行。
2023-01-16 18:36
2023年1月14日,“一眼千万年——世界琥珀艺术展”在广东省博物馆开展。该展精选700余件琥珀原矿、虫珀、植物珀、琥珀雕件、琥珀饰品、琥珀文物和琥珀艺术品,配合馆藏动植物标本,讲述琥珀的形成、分布、分类等有关科学和人文知识。
2023-01-16 10:25
2023年1月15日,云南省红河哈尼族彝族自治州蒙自市花卉市场品种繁多,购销两旺,不少市民到这里选购鲜花,迎接新春佳节的到来。
2023-01-16 09:21
2023年1月13日,江西省吉安市吉州区庐陵文化生态园色彩斑斓,呈现出赏心悦目的冬日美景。
2023-01-15 10:46
2023年1月12日,安徽省马鞍山市雨山区人武部依据《军队功勋荣誉表彰条例》,联合军地有关单位举行“送立功喜报”仪式,向二等功臣江伟家送去“二等功之家牌匾”、立功喜报和立功奖励金,营造了“崇尚荣誉 建功军营”的浓厚氛围。
2023-01-13 11:26
2023年1月12日,国家统计局数据显示,2022年全年全国居民消费价格指数(CPI)比上年上涨2.0%。工业生产者出厂价格指数(PPI)比上年上涨4.1%。从12月份当月看,CPI同比上涨1.8%,涨幅比上月扩大0.2个百分点;PPI同比下降0.7%,降幅比上月收窄0.6个百分点。
2023-01-12 17:45
2023年1月11日凌晨,中国铁路郑州局集团有限公司干部职工利用高铁“天窗”,对济郑高铁郑州万滩黄河公铁大桥进行全面检查养护作业
2023-01-12 10:19
2023年1月9日,游客在重庆市沙坪坝区的磁器口古镇游览。春节将至,千年古镇磁器口景区,熙来攘往、游人如织
2023-01-12 10:16
2023年1月10日,在湖南省郴州市安仁县,南华大学第一临床学院的研究生开展送医送药下乡的志愿者活动,他们走村串户给当地老百姓检查血压、血氧饱和度,开展义诊服务,送去健康关怀。
2023-01-11 10:19
2023年1月9日,甘肃省张掖市甘州区花寨乡的社火表演队正在文化广场上加紧排练舞龙、舞狮、大秧歌、威风锣鼓等传统民俗文化社火节目
2023-01-10 10:30
加载更多